前農長阿都阿玆被逼離開巫統另起爐灶後，公開向東姑阿都拉曼政權挑戰，但1964年大選失敗，翌年又被捕入獄，兩人恩怨落幕。

阿都阿玆與東姑在巫統內的鬥爭，是屬於一種不是很激烈與正面的交鋒，而且富有彈性，涉及的是政治觀點與手法的不同，不關私人恩怨。

從丟官到被巫統開除，其過程是這樣的：

阿都阿玆一向來是巫統內的左傾份子，他是新加坡第一任元首（總統）尤索夫（YusofBinIshak）的弟弟，1948年到1951年擔任馬來前鋒報編輯。這之間他已是巫統黨員。

阿都阿玆任部長期間，積極鼓吹馬來民族主義思想，致力通過合作社來提高馬來人生活水平，反對壟斷資本家，包括華人大資本家。他認為合作社運動是擺開剝削的最佳工具之一，因此在當時幾乎有3000間合作社，使他在農民中的影響力之大，是十分明顯的。

由於他的不放鬆的鬥爭，要內閣通過由合作社設立肥料廠，減少中間人的剝削，但不得要領，認為是太昂貴和不實際的計劃，引致東姑及其他內閣部長向他炮。

他不甘於於計劃被拒絕，繼續四處大搞運動，以形成一種壓力要內閣就範。自然而然的，與東姑的鬥爭加劇和公開，可在巫統內，也不是甚麼軒然風波。

東姑的第一個反擊是宣佈內閣改組，調阿都阿玆出任衛生部長，改由薩頓擔任農業部長。阿都阿玆公然抗拒，他說如被調職，寧可辭職。

為了避免矛盾進一步惡化，也顧忌這位農長有農民作後盾，東姑暫時不調職，緩和情勢。

可是在另一方面，東姑通過巫統內部的選舉來挫阿都阿玆的銳氣。在競選時，阿都阿玆從黨副主席跌下來，蟬聯失敗。這一下子，東姑更加有理由進行第二個反擊。在1962年10月，他促阿都阿玆辭農長職，後者在往後幾個月，以國會議員兼巫統黨員的身份，成為尖銳的政府批評者。包括站在反對黨論壇，批評政府政策和不同意聯盟處理馬來西亞的手法。

東姑再也無法忍受，巫統同樣不能容他，把阿都阿玆開除出黨。

如此一來，阿都阿玆只有另戰出路，在1963年7月宣佈成立“國民議會黨”（ NATIONALCONVENTIONPARTY），擺出馬來左派的姿態，爭取低層馬來人的支持。

為了加入左派陣線，阿都阿玆收斂其強烈的馬來民族主義意識，盡量保持溫和的形象。先後受邀在社陣與民主聯合黨的論壇發表演說。

對阿都阿玆第一個考驗是在1963年9月在雪蘭莪舉行的州議席補選，結果國民議會黨候選人敗給聯盟候選人，顯示巫統勢力保持強大，不為阿都阿玆的離黨而受損。

就在1964年大選前，阿都阿玆率“國民議會黨”加入社陣，以壯大聲勢和聯盟抗衡。因為他發現單一黨勢力有限（補選失敗也是一個重要因素），必須有結盟，才能有所作為。

1964年的大選有一個界線分明的鬥爭方向，一邊是東姑阿都拉曼領導的聯盟，東姑不理內憂外患，更不認為印尼的蘇卡諾總統的“粉碎馬來西亞”會有效應，決定在 1963年9月16日成立馬來西亞聯邦，把東馬的沙巴和砂勞越及新加坡納入馬來半島的政治結構中，全面宣揚馬來西亞聯邦，讓人民來判決聯盟的決定是否正確。

另一方是左派的社陣，增加國民議會黨後，形勢更見直逼聯盟。它擺出左的立場，反對馬來西亞的成立，不約而同的在一定程度上認同蘇卡諾的說法：“馬來西亞是新殖民地產物”。

雖然參加競選的還有霹靂的人民進步黨，檳城的民主聯合黨及新加坡的人民行動黨，還有力量不可忽視的回教黨。

結果是證明人民支持馬來西亞，東姑阿都拉曼取得輝煌的勝利，在西馬104席國會中，聯盟贏得89席，反對黨幾乎潰不成軍，尤其是社陣，因反對馬來西亞，有被認為認同印尼的看法之嫌，蒙受重挫，只有2人當選國會議員。他們是陳志勤和林建壽。馬來領袖則全被打敗，包括阿都阿玆在內。

不用說是阿都阿玆被東姑徹底打敗了，本來他們的鬥爭到此告一個段落。但在 1965年，政府採取一項大逮捕行動，指阿都阿玆捲入一場“政變陰謀”，企圖武力推翻民選政府。

政府的報告揭露：在1964年4月大選期間，印尼的代理人已在金錢上援助有關政黨。

大選過後，印尼方面安排阿都阿玆（國民議會黨主席）及哈斯諾（社陣主席）在 10月前往開羅參加不結盟會議，但不批准參加，乃會見印尼一位將領（曾任印尼駐新加坡總領事），密商謀叛，並促他們不再回國，他們並不接受，堅持回國。

接著尚有下文，一個印尼革命團體接受指示再與阿都阿玆等人聯係。在1965年正月，初步同意在1965年6月前往阿爾及利亞參加亞非國家大會，然後在那裡宣佈成立 “馬來西亞流亡政府”，指揮武裝叛變。

被指參與其事者有前農長阿都阿玆、回教黨主席巴哈魯丁醫生、勞工黨主席依薩、回教黨副主席拉惹阿武韓聶化、社陣主席哈斯諾、人民黨總秘書達朱丁、國民議會黨秘書長拿督甘巴拉柔。

政府情報局宣稱早已獲悉此事，就在他們“密叛”成事之前，採取斷然行動，將他們全數逮捕。

事件一經公佈，全國震驚，而社陣內的華人領袖皆表一概不知情。據知在流亡政府的內閣中，唯一被列為部長的華人是林建壽，內定為法律部長。

大逮捕的行動激起社陣的強烈抗議，但阿都阿玆的政治生涯就此劃上句號。國民議會黨經此打擊，消失政壇。

東姑徹鎮底戰勝阿都阿玆帶來的後遺症，兩人的政治恩怨自此落幕。